Слои можно представить как прозрачные пленки, сложенные в стопку друг на друга. Если на слое ничего нет, то сквозь него видны слои, расположенные под ним. См. раздел Изменение порядка расположения слоев.
Когда создается новый Flash-клип, в нем содержится только один слой. К этому слою можно добавить еще несколько слоев и с их помощью организовать расположение изображений и их анимацию в клипе. Количество слоев в клипе ограничивается только объемом памяти вашего компьютера. Увеличение количества слоев не приводит к увеличению размера файла, в котором будет записан клип.
Вы можете рисовать и редактировать объекты на одном слое и при этом не затрагивать объекты на других слоях. Кроме того, имеется возможность создавать так называемые "опорные слои" (guide layers), которые упрошают процесс рисования и редактирования. Также, для создания "изощренных" эффектов можно создавать слои-маски (mask layers).
Для звуков и действий (actions) используются свои отдельные слои. Это позволяет быстро находить все действия (actions) из звуки, когда вам понадобится их редактировать.
О слоях рассказывается в интерактивном уроке, которы можно запустить, выбрав Help > Lessons > 4 Layers.